El Toyota #7 lidera cómodamente las primeras 3 horas en Fuji
La carrera de las 6h de Fuji comenzó detrás del Safety car debido a las condiciones húmedas del trazado japonés. Tras varias vueltas, el coche de seguridad se fue y dejó a los verdaderos protagonistas en la pista. El Toyota #8 pilotado por Kazuki Nakajima en ese momento, pudo escapar de los ataques de los LMP1 no híbridos, mientras que el coche hermano, tuvo que luchar para escalar puestos después de haber recibido una sanción ayer y haber sido relevado al 8º puesto tras conseguir la pole.
Esta vez los Toyota no tenían las cosas tan fáciles con los prototipos de la máxima categoría no híbridos, después de haber recibido en el EoT (Equivalencia de tecnologías) un lastre que los hacía más lentos. Después de poco más de media hora de carrera, el Ferrari 488 GTE del equipo MR Sport sufría un reventón en la recta principal, destrozando la parte trasera derecha del coche y soltando muchos trozos provocando la salida del Safety car de nuevo hasta que todo se limpiara. Durante este periodo muchos equipos aprovecharon para hacer la parada en boxes y cambiar los neumáticos de lluvia por los lisos tras ver que el tiempo mejoraba considerablemente. Pero en el circuito seguía habiendo zonas húmedas y esto provocó el accidente del Rebellion #3 en la salida de la curva uno. El coche no pudo ser llevado a boxes y tuvo que retirarse y el coche de seguridad se mantuvo un rato más en pista.
Durante la segunda hora, la acción en pista fuera la normal, sin mayores incidentes. Lo destacable de esta hora fue el susto que se dio Kamui Kobayashi con el Toyota #7 al intentar adelantar a un Porsche de la categoría GTE-AM. Mientras tanto, el coche hermano aprovechaba para hacer su parada en boxes para cambiar de piloto (se sube Sebastien Buemi).
Y en la tercera hora, los dos Toyota estuvieron muy cerca uno del otro liderando 1-2. Poco a poco, Buemi le recortaba tiempo a su compañero japonés hasta tenerlo a menos de un segundo. Kamui Kobayashi estaba sufriendo mucho, pero por circunstancias del tráfico, el #8 no pudo adelantarle hasta que no se metió en pit. Tras más de dos horas al volante, Kobayashi le cedió su puesto a Conway.
